Antibiotiká sú účinné len vtedy, ak sa užívajú presne podľa pokynov lekára. Vždy dodržiavajte predpísanú dávku, čas užívania a celkovú dĺžku kúry — aj keď sa cítite lepšie po pár dňoch. Prerušenie liečby pred jej ukončením podporuje vznik antibiotickej rezistencie.
Väčšinu antibiotík užívajte s dostatkom vody a v pravidelných intervaloch, aby hladina lieku v krvi zostala stabilná. Niektoré antibiotiká sa nesmú kombinovať s mliečnymi výrobkami, antacidami alebo inými liekmi. Alkohol a nadmerná záťaž organizmu znižujú účinnosť liečby.
Antibiotiká nerozlišujú medzi škodlivými a prospešnými baktériami — ničia aj črevnú mikroflóru. Preto sa odporúča užívanie probiotík, minimálne 2 hodiny oddelene od antibiotika. Vhodné sú probiotiká s kmeňom Lactobacillus alebo Saccharomyces boulardii. Po ukončení kúry pokračujte s probiotikami aspoň 2 týždne.